Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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ZNF439Q8NDP4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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ZNF439Q8NDP4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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ZNF439Q8NDP4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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ZNF439Q8NDP4 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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ZNF439Q8NDP4 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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ZNF439Q8NDP4 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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ZNF439Q8NDP4 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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