Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS8Q8N3P4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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