Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

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Length 950 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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CCDC80Q76M96 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC80Q76M96 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCDC80Q76M96 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCDC80Q76M96 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCDC80Q76M96 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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