Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms