Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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