Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FMODQ06828 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FMODQ06828 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms