Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms