Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms