Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COG7P83436 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COG7P83436 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms