Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms