Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP46P62068 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP46P62068 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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