Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 RGS6-201ENST00000343854 5342 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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