Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNA2P51530 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNA2P51530 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNA2P51530 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNA2P51530 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNA2P51530 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNA2P51530 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNA2P51530 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNA2P51530 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNA2P51530 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNA2P51530 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNA2P51530 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms