Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms