Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NESP48681 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NESP48681 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NESP48681 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NESP48681 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NESP48681 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NESP48681 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NESP48681 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NESP48681 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NESP48681 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NESP48681 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NESP48681 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NESP48681 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NESP48681 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NESP48681 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NESP48681 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NESP48681 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NESP48681 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NESP48681 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NESP48681 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NESP48681 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NESP48681 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NESP48681 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NESP48681 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NESP48681 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NESP48681 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NESP48681 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NESP48681 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NESP48681 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NESP48681 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NESP48681 IGHV7-56-201ENST00000518372 351 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NESP48681 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NESP48681 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NESP48681 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NESP48681 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NESP48681 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NESP48681 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NESP48681 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NESP48681 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NESP48681 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NESP48681 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NESP48681 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NESP48681 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NESP48681 TPM3P7-201ENST00000338274 732 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 AL161644.1-201ENST00000426901 1111 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms