Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
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MTHFRP42898 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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MTHFRP42898 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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MTHFRP42898 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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MTHFRP42898 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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MTHFRP42898 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MTHFRP42898 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MTHFRP42898 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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