Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJC1P36383 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJC1P36383 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJC1P36383 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJC1P36383 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJC1P36383 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJC1P36383 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJC1P36383 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJC1P36383 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJC1P36383 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms