Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP1P32455 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms