Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 KRT18P45-201ENST00000515347 1333 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 TPM3P7-201ENST00000338274 732 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AL133551.1-201ENST00000610279 1222 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 MECP2-226ENST00000640414 897 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AL590491.2-202ENST00000611126 418 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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