Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms