Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC010776.3-201ENST00000617349 424 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC109826.1-203ENST00000624259 1105 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 SEPHS1P7-201ENST00000452995 1177 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 NDFIP2-AS1-201ENST00000457171 431 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 RN7SL229P-201ENST00000495651 299 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 ALG1L14P-201ENST00000514230 434 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC002351.1-201ENST00000546852 590 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRHP20396 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRHP20396 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRHP20396 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 HBD-202ENST00000380299 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 AL583824.1-203ENST00000457948 761 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 AP003096.1-201ENST00000565199 503 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 AP006621.5-202ENST00000623692 636 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRHP20396 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 UGT1A6-202ENST00000373424 1128 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 AL390726.1-201ENST00000451357 202 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms