Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LIG1P18858 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LIG1P18858 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIG1P18858 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LIG1P18858 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIG1P18858 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIG1P18858 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIG1P18858 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIG1P18858 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIG1P18858 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LIG1P18858 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms