Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms