Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 CHCHD2P6-201ENST00000454346 447 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC079742.1-201ENST00000434951 357 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC022167.5-201ENST00000636296 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DMDP11532 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 LINC02344-201ENST00000443576 644 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DMDP11532 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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