Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms