Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CREB3O43889 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CREB3O43889 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CREB3O43889 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CREB3O43889 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CREB3O43889 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CREB3O43889 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms