Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF879B4DU55 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ZNF879B4DU55 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ZNF879B4DU55 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ZNF879B4DU55 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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