Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms