Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CCDC78A2IDD5 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CCDC78A2IDD5 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CCDC78A2IDD5 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CCDC78A2IDD5 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CCDC78A2IDD5 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CCDC78A2IDD5 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CCDC78A2IDD5 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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