Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTC7AQ9ULT0 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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