Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms