Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms