Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 RFC3P1-201ENST00000454568 682 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PCDH10Q9P2E7 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PCDH10Q9P2E7 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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PCDH10Q9P2E7 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PCDH10Q9P2E7 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PCDH10Q9P2E7 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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PCDH10Q9P2E7 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PCDH10Q9P2E7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCDH10Q9P2E7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCDH10Q9P2E7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCDH10Q9P2E7 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCDH10Q9P2E7 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCDH10Q9P2E7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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