Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms