Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SEMA4CQ9C0C4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SEMA4CQ9C0C4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA4CQ9C0C4 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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