Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FYCO1Q9BQS8 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms