Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2BQ99453 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms