Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms