Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms