Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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