Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDAC11Q96DB2 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms