Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms