Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2Q8WZ74 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms