Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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CLIP4Q8N3C7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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CLIP4Q8N3C7 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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CLIP4Q8N3C7 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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CLIP4Q8N3C7 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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CLIP4Q8N3C7 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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CLIP4Q8N3C7 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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CLIP4Q8N3C7 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CLIP4Q8N3C7 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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