Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 CBWD1-222ENST00000613508 1143 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 OBP2A-207ENST00000619164 705 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 IGLV2-8-201ENST00000620395 517 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC013489.3-201ENST00000623274 517 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FAM92B-203ENST00000629253 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FAAHP1-207ENST00000635606 398 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC109635.4-201ENST00000636653 1005 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 RFC4-201ENST00000296273 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AP000289.1-201ENST00000421051 1361 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PNLIPRP1-221ENST00000534537 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 DDX6P2-201ENST00000619520 1455 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF124-201ENST00000340684 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 NAA50-203ENST00000477813 1945 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 COX6B1-201ENST00000246554 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM126A-201ENST00000304511 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 KRTAP19-2-201ENST00000334055 380 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SNORA55-201ENST00000364587 135 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 RNA5SP207-201ENST00000390874 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 KRT8P40-201ENST00000392131 563 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 THUMPD1P1-201ENST00000400014 1041 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FEN1P1-201ENST00000401028 1145 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CD24P1-201ENST00000422383 225 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms