Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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CCDC96Q2M329 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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CCDC96Q2M329 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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CCDC96Q2M329 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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CCDC96Q2M329 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC96Q2M329 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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