Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FXNQ16595 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FXNQ16595 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FXNQ16595 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FXNQ16595 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FXNQ16595 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FXNQ16595 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FXNQ16595 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FXNQ16595 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FXNQ16595 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FXNQ16595 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FXNQ16595 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FXNQ16595 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FXNQ16595 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FXNQ16595 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FXNQ16595 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FXNQ16595 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FXNQ16595 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FXNQ16595 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FXNQ16595 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FXNQ16595 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FXNQ16595 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FXNQ16595 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FXNQ16595 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FXNQ16595 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FXNQ16595 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FXNQ16595 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FXNQ16595 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FXNQ16595 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FXNQ16595 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FXNQ16595 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FXNQ16595 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FXNQ16595 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FXNQ16595 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FXNQ16595 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FXNQ16595 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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