Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms