Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms