Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN2Q02246 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms